进入秘境的关键是找到主城右侧的绿色传送门，与之互动按E键即可开启排队或进入选项，角色头顶会出现对应的立体标志作为状态提示诛仙封神传：梦幻仙游，。这是玩家开启秘境冒险旅程的官方入口，通常位于主城东部区域，靠近PvP大楼旧址附近，位置显眼易于辨认。该传送门是连接常规世界与秘境玩法的唯一官方通道，为所有符合条件的玩家提供稳定的接入服务。
访问秘境存在两种主要模式，玩家可根据自身需求选择通过公共秘境系统匹配或建立私人房間。公共秘境需玩家在主城秘境大樓處使用綠色傳送門進行排隊，系統會自動匹配隊友，此模式下職業將被鎖定且最多容納8人，若匹配時間較長也可主動邀請其他玩家組隊以加快進程。私人秘境則提供了更高的自由度，需要玩家在秘境工作台制作專屬傳送門道具，並將其放置在公會世界或個人擁有建築權限的區域，這種模式允許玩家邀請最多7名好友共同進入，並允許在挑戰過程中隨時切換職業與調整裝備，其難度會根據隊伍成員的平均戰力進行動態調整。
秘境內部是由固定數量和隨機地形構成的挑戰空間，其布局通常包含初始房間、多個探索房和最終BOSS房。玩家進入後的核心目標是完成每層秘境右上角顯示的具體任務，通常爲擊殺指定數量的怪物、收集散落的水晶或是激活特定的巨石裝置。秘境中的怪物不會重生，已被清空的房間会成为安全检查点并在地图指南针上予以标记，为玩家提供导航参考。完成任务目标后即可召唤该层的最终BOSS，击败BOSS是获取奖励的前置条件。秘境总体上还分为公共秘境mobo播放器免費版，、私人秘境以及具有固定地形和特殊機制的挑戰秘境等不同類型，以滿足不同玩家的挑戰需求。
秘境的獎勵系統層次分明，擊敗每層BOSS後會掉落提供基礎材料和低階裝備的白箱。更爲重要的是，每成功完成三層挑戰後，會出現一個需要消耗暗影鑰匙才能開啓的暗影靈魂箱，即黑箱。開啓黑箱能获得水晶品质的装备、月魂、泰坦之魂等关键进阶道具。游戏设有每周奖励机制，每周开启的前六个黑箱必定包含月魂和泰坦之魂，后续开启的黑箱则主要产出毁坏的神魂等资源。暗影钥匙本身由钥匙碎片合成，而钥匙碎片主要通过挑战U1及以上难度的主世界副本随机掉落。