江南百景图内部分建筑支持拆除，并非全部建筑都能执行拆除操作，建筑能否拆除由建筑类型决定，同时游戏还提供收纳进仓库的替代方案，两种处理方式的资源返还与使用逻辑存在明显区别。
想要执行拆除操作有两种通用操作路径，第一种是直接长按地图上的目标建筑，等待界面弹出改布局操作栏，找到锤子样式的拆除图标确认即可；第二种是点击屏幕左下角对应城池的官府印章，选中改布局功能，全局进入编辑状态后批量选中多座建筑完成拆除。可拆除建筑包含民宅、各类生产工坊、普通娱乐装饰、桥梁、围栏、人工湖、限时活动建筑与老字号商铺等，拆除这类建筑会按比例返还建造消耗的木材、砖块、食材等基础资源，铜钱不会退还，部分特殊商铺如老字号仅返还八成对应的专属货币资源，民宅拆除前需要提前迁移内部居民，否则居民会变为无住所状态，中断工坊生产效率。收纳仓库和直接拆除要做好区分，收纳只是临时收回建筑，后续可免费重新摆放，不会损失资源，适合仅临时调整布局的情况，拆除属于永久销毁建筑，资源会折损返还，适合彻底清理多余建筑、释放地块空间。
游戏内存在大量完全无法拆除的建筑，这类建筑只能移动位置或者旋转朝向，没有拆除功能按钮，其中涵盖城池基础仓库、州府官府、税课司、监牢、探险解锁的固定地标建筑、补天石建造的专属仓库等。这类建筑作为城池运转的核心基建，建造后永久留存，前期规划地块布局时需要谨慎选定位置，避免后期地块紧张却无法清理腾出空间。不少新手容易混淆仓库收纳与拆除的功能，大批量装饰建筑、重复活动摆件优先选择收纳，既能保留建筑道具，又能随时取出美化城市，只有重复冗余、不再需要的生产建筑才建议拆除，减少资源占用。
拆除建筑还有不少容易忽略的实用细节，拆除民宅前需要核对当前主线任务要求，若任务规定城池内需保有指定数量民宅，提前拆除会导致任务停滞，需完成任务阶段后再清理多余房屋；各类工坊拆除前要清空正在生产的物资，未完成的生产进度会直接清零，无法补偿产出道具；道路类地块无需走建筑拆除流程，直接在道路区域拖动涂抹就能清除路面，操作效率更高。长期规划多城池布局的玩家，可以统一管理装饰建筑库存，严大人兑换的重复装饰全部收纳仓库，只拆除量产的基础工坊，平衡地块空间与资源储备，避免频繁建造拆除造成大量资源损耗，提升整体城市经营效率。