江南百景图仓库分为三类存储入口，物资仓库查看入口在主界面右下角三点菜单行囊图标，实体仓库建筑在营造居住栏建造摆放，建筑收纳仓库在营造界面已存分区，香料仓库内嵌于客栈内部。
物资仓库是存放农林、工坊产出食材、木料、布匹等资源的核心存储界面，调取路径操作清晰直观，进入城市主界面后，找到屏幕右下角省略号样式的功能菜单按钮，点击展开全部功能，包裹外形的行囊图标就是物资仓库入口，点击即可查看当前所有存储物资、各类资源占用容量，同时能快速消耗材料建造建筑、完成任务交付。该界面不受城市分区限制，切换应天府、苏州府、杭州府等城池后，对应城池独立物资库存会同步刷新，无需额外移动实体建筑即可调取资源，是日常清点库存、调配生产物资最常用的入口，新手极易混淆实体仓库建筑与该菜单入口，二者功能独立互不冲突，菜单行囊仅为查看面板，实体仓库建筑才是提升总存储容量的关键。
实体仓库建筑需要手动建造摆放，建造位置在屏幕底部营造按钮，点开后切换至居住分类，列表中能找到普通仓库与砖砌仓库两类建筑，普通仓库四阶解锁，占用1×3地块，建造消耗铜钱、食物与原木，应天府、苏州府、杭州府最多建造六座，松江府仅可建造两座，砖砌仓库十一级解锁，消耗补天石建造，单座基础存储量更高。摆放实体仓库有硬性规则，地块必须铺设道路连通，红色地块无法放置，绿色地块可正常落成，布局推荐两种实用方案，集中式布局将全部仓库统一安置在城门内侧财神雕像周边，靠近码头与工坊集群，收取产出、运输物资操作距离最短；分散式布局在农田、林场、织布坊等大型生产片区各安置一座仓库，避免单次产出直接爆仓，减少反复调取库存的操作频次。实体仓库落成后可通过左下角府印按钮进入改布局模式，长按仓库建筑三秒完成选中，支持旋转、移动位置，但无法跨城池搬迁，也不能直接拆除，只能在本城池内调整地块。
游戏另外两类专属仓库拥有独立存放区域，建筑收纳仓库无需实体建筑，同样在营造界面，点击顶部“已存”标签即可进入，玩家长按城内装饰、娱乐、闲置生产建筑时，选择收纳选项会自动存入该分区，基础格子数量有限，开通月卡可解锁无限收纳空间，民宅、州府、码头等核心功能性建筑无法收纳；香料仓库无独立摆放位置，完全依附客栈建筑，点击已摆放的客栈建筑就能打开香料存储界面，花椒、香油、八角等经营专用香料全部存放于此，客栈等级越高，香料仓库总容量越大，与普通物资仓库数据完全分隔，不会占用通用存储额度。