火影忍者冒险模式更换秘卷，需要在关卡开战前的阵容准备界面完成设置，无法在战斗过程中临时修改秘卷，同时冒险模式沿用独立的阵容配置，和决斗场的秘卷装备互不互通，很多玩家直接在主界面更换秘卷，进入冒险副本依旧沿用旧配置，就是忽略了这一机制。进入冒险模式之后，选定要挑战的普通副本或者精英副本，点击关卡进入战斗准备页面，在这个页面右下角找到调整阵容按钮，点开之后就可以看到秘卷选择区域，点击秘卷图标，从已经学习解锁的秘卷列表内挑选想要使用的秘卷，确认装备之后再点击开始战斗，新的秘卷就会生效在本次冒险关卡当中。
需要注意秘卷系统需要等级解锁，没有开启秘卷系统的情况下，冒险模式无法配置秘卷，只有成功学习激活的秘卷才能够进行装备，只收集碎片没有完成学习的秘卷不会出现在选择列表内。主界面秘卷栏的装备操作，只会改变决斗场、训练场的秘卷配置，不会同步到冒险副本，这是高频踩坑点，不少玩家反复在主页切换秘卷，进副本发现没有变化，根源就是冒险模式必须在关卡准备页单独调整，每次更换出战忍者之后，也建议再次核对秘卷状态，避免阵容重置导致秘卷退回默认配置。
冒险模式刷图对于秘卷有明确的选择倾向，刷图优先群体伤害、聚怪、追踪类秘卷，风遁风杀阵可以聚拢大批小怪，大幅提升清图效率，火遁裂炎弹依靠自动追踪，面对分散刷新的敌人不容易空技能，通灵来去手里剑拥有短冷却和贯穿伤害，适合快速清理成片小怪，推进主线刷取装备养成材料的时候实用性很高。遇到BOSS关卡，则可以选择霸体类秘卷，规避BOSS的控制技能，保证忍者连招不会被打断，解术类秘卷可以解除BOSS施加的异常debuff，提升生存容错，秘卷等级越高，伤害倍率、冷却缩减、持续效果都会得到提升，长期刷图可以优先把高频使用的刷图秘卷进行升级，进一步降低通关难度。
精英副本和普通冒险副本的秘卷配置规则完全一致，扫荡操作不会读取秘卷配置，只有手动点击挑战进入实战战斗，设置好的秘卷才会生效。如果调整阵容后秘卷依旧不生效，可以退出当前冒险关卡，重新进入准备界面二次确认装备状态，同时检查秘卷是否处于已学习状态，碎片不足未完成学习的秘卷不能选用。小队突袭是秘卷碎片最主要的获取渠道，坚持参与玩法积累碎片，解锁更多秘卷之后，面对不同冒险关卡就可以灵活切换适配，不管是刷主线拿经验装备，还是刷精英副本获取忍者碎片，合适的秘卷搭配都能够减少通关耗时，降低通关操作压力。