纪念碑谷水宫入口的进入方法是在完成主场景的光影机关解谜后，通过触发隐藏的水下通道开启互动，沿着水流折射的光路找到并点击位于水潭底部的神秘石门即可进入。
想要解锁水宫入口，首先需要在主场景中找到三处核心光影机关，这三处机关分布在水潭周边的石柱与平台之上，彼此通过光路相连。操作时需依次调整机关的角度，让光线依次穿过第一处机关的棱镜、第二处机关的反光镜，最终投射到第三处机关的感应点上，整个过程中光线的折射路径会在水潭壁上形成清晰的光路标记，玩家需要顺着标记的指引确认机关调整的方向，每一次机关角度的变化都会同步改变光路的走向，只有当第三处机关的感应点被完全点亮，水潭底部的石门才会显现出半透明的轮廓。
光影机关完成联动后，水潭的水位会发生细微变化，原本隐藏在水下的石阶会逐渐露出水面，同时潭水中会出现流动的光流指引，玩家需要沿着光流的方向移动，光流会自动引导玩家靠近水潭底部的石门位置。此时靠近石门会触发互动提示，点击石门后会进入一段短暂的水下场景，场景中会有可触碰的发光珊瑚，触碰珊瑚后会解锁石门的最终开启条件，珊瑚的触碰顺序会影响水下通道的稳定性，按照光流标注的顺序触碰即可顺利通过。
进入水下通道后，通道内的墙壁会随玩家的移动亮起动态的光影纹路，这些纹路其实是隐藏的路径提示，玩家需要沿着亮起的纹路方向前进，避免触碰未亮起的区域，否则会触发通道的反向传送机制，被送回水潭入口重新解谜。通道中段会出现一处旋转的水涡机关，该机关需要通过调整前方平台的机关角度来控制水涡的旋转方向，让水涡的水流推动玩家穿过通道的狭窄缝隙，这里需要注意机关调整的时机，需在玩家靠近缝隙前完成角度设定，否则水流的推力会失效。
穿过水涡机关后，前方会出现水宫入口的标志性拱门造型，拱门两侧的石壁上刻有与主场景光影机关对应的纹路，对照纹路的形状再次调整主场景的光影机关，可解锁入口处的隐藏宝箱，宝箱中包含水宫专属的装饰道具与解谜线索。完成这一步后，拱门的石门会自動開啓，正式進入水宮內部場景。