植物大战僵尸水族馆的核心玩法是通过喂养潜水僵尸收集阳光，累计获得1000点阳光后购买奖杯即可通关，全程以经营喂养为核心，无传统塔防对抗环节。开局会获得50点初始阳光与2只潜水僵尸，玩家的核心操作是点击水族馆背景消耗5点阳光制造脑子，脑子会缓慢下沉，潜水僵尸会主动游向吞食，成功进食后便会定期产出25点阳光，这是获取阳光的唯一途径。潜水僵尸存在饥饿机制，长时间未进食身体会逐渐变绿，完全变绿后仍未投喂就会死亡消失，直接减少阳光产出，必须时刻监控僵尸体色，及时投放食物维持存活。
喂养操作的效率直接决定阳光积累速度，投放脑子时要选在水族馆上半区域点击，延长脑子下沉时间，提升僵尸吞食概率，同时要控制投放节奏，水缸内最多同时存在3个脑子，避免过量投放导致脑子沉底浪费。初期仅需专注喂养2只初始僵尸，确保每只僵尸在体色泛黄时就能吃到脑子，不要连续两次漏喂，待完成3轮以上完整喂养循环、阳光余额稳定超过120点后，再考虑扩张规模。此时花费100点阳光购买新潜水僵尸，能提升整体阳光产量，新僵尸入场后要立即在其附近高位投放脑子，让其快速进入稳定生产状态。
扩张僵尸数量需把握平衡，并非越多越好，通常维持4至6只僵尸最为合适，既能保证阳光产出效率，又不会因喂养压力过大导致阳光储备不足。每只僵尸都要单独关注，多僵尸共存时，要按饥饿顺序依次投放脑子，优先投喂体色更绿、饥饿程度更高的僵尸，避免因顾此失彼导致僵尸死亡。阳光积累过程中要预留应急阳光，不要将所有阳光都用于购买僵尸，始终保留至少50点阳光用于紧急投喂，防止突发饥饿时无阳光制造脑子，造成僵尸死亡、产能中断。
当累计获得的阳光总量达到1000点时，即可点击界面中的奖杯选项完成购买通关，这里的累计阳光包含所有消耗与产出，并非仅看当前持有阳光。通关后首次可获得1000游戏币与金杯奖励，后续重复游玩能获得250游戏币，也可在此关卡长期积累阳光，完成相关成就任务。整个过程核心是精准把控喂养节奏、合理扩张僵尸规模、稳定维持阳光收支，一步步达成1000阳光的通关目标。