主线中最容易迷路的洞窟是岩山隧道，正确路线号道路进入，穿过后从南侧出口离开，继续向南即可到达紫苑镇。进入前建议先在洞口旁的宝可梦中心恢复体力，并准备超级药水、解麻药、解毒药和1个逃脱绳。洞内野生宝可梦与训练家等级大多在20级上下，队伍平均等级达到20至25级会更稳；若只想尽快通过，可携带喷雾减少遇敌。
闪光是最可靠的通行方案，但不是进入或通关岩山隧道的硬性条件。打败枯叶市道馆马志士后，先从枯叶市东侧进入11号道路，再进入地鼠洞，从另一端回到2号道路；砍掉附近的小树，进入关卡房屋与大木博士助手对线种不同宝可梦后即可获得HM05闪光。队伍里要有能学习闪光的宝可梦，并且已经拥有岩石徽章，这样才能在洞外使用闪光。只登记见过而没有捕获的宝可梦不计入10种条件。
进入岩山隧道后，按梯子—下层—梯子—上层—梯子—下层—出口的顺序前进即可。第一层先向下经过科学家，再沿通道走到梯子处下楼；到下层后先向下再向左，在第一个明显岔路转入，沿路找到第二个梯子上楼。回到第一层后绕着房间向下走，找到下一处梯子再次下楼；下层区域一直向东走到尽头，再向北经过另一名科学家，爬最后一个梯子回到第一层。此时向下移动后向东走，沿通道寻找出口即可。不要把拿道具、挑战训练家和寻找稀有宝可梦当成必经路线，看到分岔时优先寻找梯子和通向外侧的长通道。
没有闪光时仍然可以通过，但屏幕只显示角色周围很小范围，容易撞墙、漏掉梯子或反复走回原路；迷路后应退回最近一次确认过的梯子，不要在低血量状态继续盲走。若队伍需要练级，可在洞内使用水系、草系或格斗系招式处理地面、岩石和超能力系训练家，电系宝可梦不适合单独承担战斗。穿出南侧出口后沿10号道路向南走，抵达紫苑镇后先恢复体力，再进入宝可梦塔；首次到达时推进到幽灵挡路的位置即可，之后前往彩虹市处理火箭队基地，取得重要道具后再回来继续探索。