初期护卫舰优先按承伤、输出、对大船特攻来选，而不是单看稀有度：没有强力蓝图时，先用fg300装甲型稳住前排；抽到红宝石级、刺水母级或澄海级后，再把资源集中到这些主力型号上。以泛用开荒为目标，推荐顺序是红宝石级重型轨道炮、刺水母级战术型、澄海级重型或鱼雷型；若主要任务只是打低级私掠者和完成主线装甲型配少量输出护卫舰已经够用，不必一开始就把所有护卫舰都升满。护卫舰本身指挥值低、生产成本相对较小，适合在驱逐舰数量不足时快速补充舰队。
没有高价值蓝图时，FG300三种型号应按舰队缺口选择：装甲型放在前排承担伤害，多用途型负责过渡输出，侦查型更适合机动、侦察或补充速度，不建议把它当成长期主力火力。官方档案中，FG300装甲型的武器系统和装甲系统结构值为4000、4800，多用途型为3000、2800，侦查型则偏向动力系统，说明三者并不是简单的高低关系，而是承伤、火力与机动的取舍。资源紧张时，先生产装甲型保证舰队不易，再把技术值投入真正要长期使用的输出舰，避免同时培养三种FG300导致金属、晶体和技术值分散。
拥有主力蓝图后，红宝石级重型轨道炮适合优先培养，特点是单发实弹伤害高、对中大型舰船威胁明显，适合主线精英敌人、城市守卫和敌方大船较多的战斗；刺水母级战术型带有机库和舰载机，持续输出更灵活，但自身不能单独承担前排压力，最好与装甲型或其他承伤舰混编；澄海级重型、鱼雷型适合攻击中大型目标，在缺少红宝石和刺水母时可以作为稳定替代。雷里亚特级隐身型则更偏向生存和针对大船，适合刷野、偷袭或需要减少损耗的队伍，但不宜在只有一队主力时完全替代泛用输出。官方数据与主流实战评价都显示，红宝石、刺水母、澄海的核心价值集中在对中大型舰船造成有效伤害。
实际编队可采用一艘承伤型加两到数艘输出型的思路，先用装甲型吸收火力，再让红宝石、刺水母或澄海稳定输出；面对敌方舰载机较多的目标，再考虑静海防空型、云海防空型或其他防空护卫舰，不能为了追求面板伤害而完全放弃防空。技术值应优先强化主力舰的主武器伤害、冷却、命中或舰载机效率，承伤舰则优先提升装甲、耐久和生存相关项目。开荒阶段只挑战有稳定胜率的私掠者，1至4级可根据舰队损耗逐步推进，5级以上应等驱逐舰数量和舰船等级提高后再尝试；战斗失败会造成大量舰船损失，盲目堆护卫舰数量反而会拖慢基地升级和后续驱逐舰生产。