少年三国志零是一款主打4×4网格战前布阵、兵种克制与兵将军师三位一体搭配的策略卡牌对战游戏，整体玩法围绕策略布阵闯关、武将兵种养成、多人竞技对抗以及特色副本挑战四大模块展开，区别于传统自动战斗卡牌游戏，全程依靠站位逻辑、兵种克制和技能时机来决定战局胜负，数值碾压并非获胜唯一途径。
游戏最核心的战斗玩法是16格网格布阵系统，出战最多布置八个作战单位，每个单位由一名主将搭配一队对应兵种小兵组成，六大兵种拥有固定克制链条，盾兵克制弓兵、弓兵克制步兵、步兵克制骑兵、骑兵克制盾兵，谋士依靠法术穿透无视物理防御克制肉盾单位。常规实用布阵逻辑为盾兵、步兵放置在前两排承受伤害，弓手与谋士安置在后排远程输出，轻骑、重骑放在两侧角落伺机绕后突袭敌方后排脆皮单位，重骑的开场冲锋可以打乱敌方前排阵型，轻骑则专门针对无保护的弓兵和谋士进行秒杀。战场支持百兵同屏作战，小兵会跟随主将自动行进交战，玩家无法手动操控单个士兵，只能依靠战前布阵和军师技能干预战局，同战力下合理利用克制关系可以实现越级通关。武将存在阵营羁绊与流派体系，不再局限固定国家队阵容，野兽流、骑战流、火烧流、盾防流等三十余种流派都可以通过自由搭配成型，部分紫卡武将依靠羁绊搭配也能发挥不输橙将的实战效果。
养成类玩法贯穿游戏全程，也是支撑布阵对战的基础，武将主要通过求贤招募、九州地图探索、副本星级奖励、商店碎片兑换获取，养成路径包含升级、突破、升星、装备锻造、兵符装配、兵种科技升级几个部分。资源分配上不建议平均培养多名武将，优先集中资源拉高一名核心输出主将的星级与装备，再搭配两名前排承伤武将和一名辅助谋士构建基础队伍，兵种科技需要跟随主力流派升级，弓兵流派优先点射程与暴击，骑兵流派点移速与冲锋伤害，盾兵流派堆叠格挡和生命值，兵种科技带来的整体加成往往高于低星级武将升星收益。九州大地图探索是日常资源获取的重要玩法，在开放地图中行走可以触发随机事件、遭遇野外敌兵、解锁隐藏宝箱，还能解锁华容道、辕门射戟等限定特殊副本，华容道采用塔防限制玩法，仅允许谋士和弓手参战，辕门射戟则考验精准击杀顺序来获取高分评级，两个副本产出大量锻造石与军师技能书。
PVP竞技与军团社交玩法提供长线对战乐趣，巅峰竞技场是主流实时匹配对战模式，对手阵容完全未知，需要提前准备两套不同流派阵容随时变阵，应对全盾肉队、快攻骑队、远程弓队三种主流对手，对战积分可以兑换高阶军师碎片与稀有符石材料。赛季竞技会根据分段发放对应排行奖励，高阶段位可以解锁专属头像框与军功册道具。军团玩法支持多名玩家组队参与军团讨伐、军团秘境团战，共同攻打世界BOSS获取军团贡献，贡献值可以在军团商店兑换稀有武将碎片与晋升道具，晋升台能够将低资质武将晋升为高阶红将，大幅提升队伍上限。符石系统属于后期进阶养成玩法，通过符石大作战副本抽取各类属性符石，给主将镶嵌符石可以强化兵种特性，化神玩法更是能解锁武将专属进阶技能，进一步拉开流派之间的战术差距。