部落冲突里的仓库分为两类，存放金币、圣水、暗黑重油的实体仓库建筑分布在村庄地图上，而宝库以及魔法物品仓库则收纳在部落城堡内部，很多新手容易混淆这两套存储位置。实体仓库包含储金罐、圣水瓶、暗黑重油罐，直接摆放在村庄的布局格子当中，打开村庄主界面就能直接看见；宝库和魔法物品仓库没有独立的地图建筑，点击部落城堡，就能切换到宝库、魔法物品分页查看对应的库存内容。不少玩家收到奖励存入仓库的系统提示时，找不到入口，大多是误把实体资源罐和城堡内的宝库混为一谈，分清两者的用途，就能快速定位仓库。
地图上的储金罐、圣水瓶、暗黑重油罐就是常规资源的实体仓库，这些3×3占地的建筑可以建造多座，大本营等级越高，能够解锁建造的仓库数量越多，升级建筑还能同步提升存储上限与自身生命值。金矿、圣水收集器产出的资源，点击收集之后会直接存入这几类仓库，进攻掠夺得来的金币圣水，同样优先填充实体仓库。这些仓库会被敌方进攻掠夺，对手摧毁仓库建筑之后，就可以拿走内部一部分资源，雷电法术无法对这类仓库造成伤害，只能依靠地面、空中部队破坏建筑来获取物资。布置阵型的时候，仓库尽量放置在防御火力覆盖的内层区域，分散摆放可以避免被对手一次性掠夺大量资源。
部落城堡内部的宝库，属于另一套特殊仓库，部落战奖励、胜利之星奖励会全部存入宝库，不会直接进入地图上的储金罐与圣水瓶当中。点击村庄里的部落城堡建筑，弹出交互面板之后选择宝库标签，就可以看到宝库内囤积的金币、圣水、暗黑重油，点击收集，资源才会转移到实体仓库。宝库内的资源受保护，敌人进攻村庄，即便摧毁部落城堡，也无法抢走宝库里面存放的物资，宝库的存储上限会跟随大本营等级、部落等级提升，一旦宝库存满，后续获取的胜利之星奖励就会直接流失，需要定时收取，避免奖励白白浪费。魔法药水、魔法书这类魔法物品，同样收纳在部落城堡的魔法物品仓库分页，在这里可以查看全部道具库存，直接使用各类增益道具。
實戰發展過程中，倉庫的規劃會直接影響村莊發育節奏。實體倉庫容量不足時，采集器和掠奪獲取的資源會出現溢出，無法繼續積攢物资，此时优先升级仓库，再去升级其他建筑，是稳妥的发育思路。宝库要养成定期收取的习惯，打完部落战、完成胜利之星之后，及时把宝库资源提取出来，充分利用奖励资源。防守阵型设计上，不建议把全部仓库集中堆放在同一个角落，集中摆放容易被石头人、巨人这类肉盾部队快速突破，造成大量资源损失，分散放置在多个防御塔的保护圈内，可以拉高对手的进攻成本。分清实体仓库和城堡宝库的区别，能避免出现拿到奖励却找不到资源的情况，让资源积累的效率得到明显提升。