江南百景图仓城布防核心是在松江府北仓城的网格地图中，优先派遣高探险属性居民，抢占过半数据点并处理随机事件，即可稳定抵御倭寇入侵，同时可通过合理储备物资与人员调配提升布防效率。
仓城布防玩法仅在松江府解锁南北仓城后开启，倭寇入侵活动期间进入北仓城即可触发布防界面。布防地图为网格布局，白色为己方初始区域，黑色为倭寇区域，灰色为待占领区域，据点数量随仓库等级提升，二级仓库3个据点、三级4个、四级5个，占领超过半数据点即可获胜。布防时只能占领相邻灰色格子，每个格子需派遣一名居民，占领期间居民无法执行其他任务，格子占领所需人力会随进度递增。
居民选择是布防高效的关键，优先选用探险属性高的特殊居民，如仇珠、徐霞客、玄奘等，搭配提升探险属性的珍宝（如仇轮、风火轮）可大幅缩短占领时间。部分特殊居民技能可减少工人需求，如武则天，能降低高等级格子的占领人力成本。日常需提前储备6-8名闲置居民，避免布防时角色被其他任务占用，导致关键格子无法及时占领。
物资储备与事件处理直接影响布防成败，需提前囤积蚕丝、丝绸、粘土、瓷器等常用物资各200份左右，可通过漕运从其他府调配，采用少量多次的运输方式减少等待时间。布防时部分格子会触发随机事件（问号格子），需派遣探险居民消耗少量资源或时间解决，处理成功可获额外奖励；派遣非探险居民易导致事件失败，让倭寇反超进度。遇到宝箱格子需优先占领，可获取画轴残片、灵魂颜料、补天石等奖励。
布防策略需兼顾效率与拦截，优先抢占倭寇入侵路径上的格子，形成拦截防线，阻止倭寇推进。再集中兵力占领据点，无需占领全部格子，守住过半数据点即可稳胜。高阶探险居民与低阶普通居民交替放置，可最大化人力利用效率，避免高阶居民浪费在低难度格子上。布防过程中可使用加速票或补天石缩短占领时间，提升布防速度。