除了对普通敌人的侵入之外，这套机制还有几个特殊的应用场景。第一个场景是侵入导弹，游戏里有些敌人会发射追踪弹来攻击人物，那自己就可以趁着追踪导弹飞过来的时候，直接举枪瞄准它以启动侵入面板。后续只要在短时间内完成一笔画路径，那么那些侵入成功之后的导弹就会当场叛变，直接掉头飞回去炸掉自己的发射源。
第二个场景是侵入带红色护盾的敌人，有些精英怪和BOSS身上套着一层红色的能量护盾，这种状态下直接举枪是无法触发侵入面板的。人物得先用枪把这层红色护盾给打烂，等护盾碎裂之后再举枪瞄准，然后侵入功能才会正常启用。第三个场景是侵入环境设施，除了对付敌人之外这套机制还能用来黑掉各种门禁面板，接着还有开关、炮台和障碍物移开装置等等，这类环境侵入在解谜和推进地图的过程中必不可少。另一个很实用的技巧是格子进度的保留机制，只要人物在侵入面板上开始画线，哪怕画到一半没有走到终点，那这个进度也是不会突然丢失掉的。
人物可以随时放下枪跑路、滑铲闪避、跳跃或者干任何其他操作，反正之前走过的格子路径都会原封不动地保存下来。人物可以提前把路径都铺好，只差最后一步不去碰绿色节点，然后等敌人出现破绽或处在容易被集火的位置时，再走完最后那一步瞬间触发侵入效果，这样就能在敌人最脆弱的时候第一时间接上高额输出。到了中后期对侵入模块芯片的选择也要注意，一般高热模式芯片是目前公认最好用的一个。它能大幅拉高敌人热量条积攒的速度，搭配上升温侵入节点之后，可以很快地把敌人耐力条打满，然后迅速贴脸去打一个处决。不管是打BOSS还是清小怪，这套组合的效率都是最顶级的。
增幅模式芯片适合那些走控制流和增伤流的打法，它能强化宕机、混乱、解码等侵入节点的效果，大幅延长控制时间或者提升傷害加成。關于侵入節點的選擇，新手階段優先攜帶宕機、混亂和升溫這三個。這裏的宕機是硬控神器，選中敵人之後直接把它定在原地，不管自己是要打弱點還是要處決或者是拉扯走位，只要有了宕機就可以說穩得不行。混亂這個節點在處理群怪的時候簡直是神技，能讓小怪們互相攻擊，就算只對著一個敵人用它也照樣會原地挂機游戏攻略永劫无间第一个武器买什么，，这一点要比单纯的控制更省子弹。再往后的升温是后期的核心点，效果是能让敌人更快过热，然后自己快速打满耐力条触发处决。