方舟里最常见的杂兵有两种，第一种是全身惨白的丧尸，这种怪的特点就是不会像普通丧尸那样，如果爆头没爆干净的话就发生变异。实际打起来的时候要相对省心一些，随便拿把枪对着头射击就能解决掉。要是自己当前走的是格蕾丝线，那么合出个燃烧瓶直接扔过去就能秒杀白色丧尸，这也算是最省事的处理方式了。
另一种是穿防弹衣的方舟士兵，这些敌人并不是丧尸所以不会变异，平时直接用步枪瞄着头射的效果是最好的，对付躲在掩体后面的士兵用狙击枪一个个点名就能解决。然后方舟里威胁最大的怪是哪些舔食者，这种东西在方舟的多个场景里都会出现，等去到生物武器储存室的时候到处都是。舔食者的主要机制是双目失明但听觉超级敏锐，人物靠近的时候要是发出太大动静的话，就会当场被它发现并追击。在方舟流程里第一次遇到舔食者的时候，它会从天花板上面直接掉下来发动突袭。
平时应对舔食者有个非常关键的技巧，就是当它试图伸出舌头攻击的时候，看准时机用斧子格挡就能触发弹反。等弹反成功之后可以直接把它的舌头给砍下来，同时还能顺带解锁一个叫为什么不吭声的奖杯。自己玩的是格蕾丝的时候可以合成一种硫酸瓶，把这东西往舔食者身上一扔就能瞬间将其秒掉。在生物武器储存室那种舔食者扎堆的地方，也可以用冲锋枪扫射或者扔手榴弹清场。此外方舟中还有一种人类敌人也就是精英卫队，在服务器室和后勤通道东侧的库房里都会遭遇这些卫队连击无双（别碰这三国-商城版）！。对付精英卫队的时候尽量别跟他们正面硬拼冲锋枪火力，利用黑暗环境先潜行起来，然后从背后悄悄靠近用斧子处决是最稳妥的办法。后续库房里头还有个持盾的精英卫队特别难缠，直接用枪打正面的话是很难看到有效果的。这时候可以射爆旁边的生物武器培养罐，以此直接把里面的舔食者放出来诛仙封神传：梦幻仙游，，然后让舔食者和持盾卫队互相掐架，在这期间自己悄悄从背后偷袭就能将其解决。
再往后走方舟里的压轴戏是精英卫队指挥官BOSS战，这人的穿着打扮和说话声线都跟传说中的死神汉克一模一样。精英卫队指挥官手持一把独特的短斧，将其打败之后自己能拿到一把名为夺命锋的斧子。打这个BOSS的时候用枪很难打中，所以自己必须熟练掌握斧子招架的技巧。打的思路就是看准时机用斧子挡下他的攻击，然后再抓破绽挥斧子打反击，有时候招架成功的话还能把他击晕，这时候上去补一套体术攻击就能打出很不错的输出。