要完成东厂线，首先必须满足一系列特定的剧情触发条件，整个流程始于游戏早期的关键抉择。在第二年十一月上旬的杭州事件中，玩家需要选择跟随秦红殇和萧遥前往海鲨帮对抗倭寇，这一选择是开启东厂结局路径的绝对前提，同时会关闭丐帮线的可能性。此后诛仙封神传：梦幻仙游，，在第三年九月初，通过闲逛功能在森林中会遇到正被缉捕的丁泓，此时务必选择事关重大，且慢动手的选项来开启后续剧情，这个事件最迟必须在第三年十二下旬之前触发，否则东厂线将永久关闭。在第四年八月上旬，萧遥会前来告知保护勤王后裔的决心，玩家必须在此选择坚持帮助萧遥，方能正式进入东厂线的大地图剧情阶段。
成功进入东厂线后，游戏将自动转入大地图模式，并开启一系列连续的剧情任务。流程的第一步是前往成都的破庙触发救援事件。完成该事件后，需立即前往杭州的灵隐寺继续剧情。任务会指引玩家前往金风镖局处理事件，完成后再返回灵隐寺复命。接下来的环节是前往海鲨帮进行战斗，胜利后同样需要回到灵隐寺。之后的任务是前往西域村落，经历战斗后再次返回灵隐寺复命。在灵隐寺复命时会触发新的战斗事件，事件结束后需前往渡头与陆少临交谈，并最终前往宝藏岛准备结局战斗。
东厂线的战斗环节有其独特的策略要点，合理利用游戏机制是顺利通关的关键。在海鲨帮等前期战斗中，如果感到战力不足，可以多使用霹雳雷火弹等道具来辅助取胜。进入与丐帮、少林等势力全面开战的阶段后，战术核心在于巧妙运用剧情中支援的各类NPC。东瀛刀客拥有拉人的技能，可以将敌方小兵牵引至我方人群中进行集火消灭，而三名厂卫则主要负责承受伤害，保护我方输出单位。需要反复出现的敌人柯祥龙拥有极高的闪避率，应对时需要格外小心。在面对最终战斗时，确保我方防御型技能的覆盖，提升整体队伍的生存能力至关重要。
东厂线作为一条重要的剧情分支，其内容和结局会受到玩家前期多项选择的影响。这条线路的剧情相对于主线较为独立，深入涉及朝廷纷争与宝藏秘密。玩家在养成模式中的不同选择，例如与萧遥的关系深浅，或是否触发了某些特定角色如沈澜的相关事件，都会对东厂线的具体剧情细节和最终战斗阵容产生微妙影响。