雇佣舰长是提升战斗力和资源获取效率的重要伙伴。增加雇佣舰长主要通过舰长招募系统实现，分为中级和高级两个卡池。中级卡池使用中级合同书招募，每日限购5次，最高可获得史诗品质艦長；高級卡池使用高級合同書招募，擁有保底機制英雄聯盟手遊蓋倫佩戴什麽—，，十連必出史詩艦長，百次必出傳奇艦長。傳奇艦長可駕駛T3科技等級艦船，是後期核心戰力。除招募外，7日登錄活動可免費獲得1位史詩艦長，節日活動或特殊任務也可能提供高級合同書。
中級合同書可通過商貿區或軍團商店購買，適合初期積累中堅力量；高級合同書獲取難度較高，需通過每日特惠、克隆體維護或活動獎勵逐步收集。由于中級卡池無保底機制，獲取進攻型史詩艦長需一定運氣，建議優先將資源投入高級卡池以穩定提升戰力。低品質艦長雖屬性較弱，但可用于懸賞任務或采礦，不應輕易退役。
舰长的职业分为军人、科学家、探险家和工程师，各自擅长不同领域。军人适合战斗援护，科学家加速科研，探险家提升采矿效率，工程师优化生产。派遣舰长执行悬赏或采矿任务可获取经验值，同时通过训练界面消耗记忆移植体快速升级。舰长等级受指挥官等级限制，需同步提升指挥官等级以解锁更高潜力。高品质舰长先天携带高级特长，后天特长可通过升级或特长芯片学习王者荣耀墨子打野出装出什么，，建议优先培养传奇或史诗舰长。
若舰长培养方向不符需求，可通过退役返还经验值并保留1项后天特长。退役所得的记忆移植体和特长芯片可用于培养新舰长，形成资源循环。援护设置最多支持3名舰长，按优先级出战，建议将军人设为援护主力以平衡攻防。探险家驾驶工业舰时货仓容量影响采矿效率，需针对性强化相关特长。