大掌门手游武功分为外功与内功两大体系，涵盖甲、乙、丙三级，核心甲级外功有天山六阳掌、黯然销魂掌、降龙十八掌、独孤九剑、乾坤大挪移、打狗棒法，内功则以九阳神功、化功、金钟罩、长生功为主，搭配不同弟子可形成多元战斗流派。
甲级外功是输出核心，天山六阳掌为当前强势群攻，内力转化伤害比例极高，每点内力可转化1.75点伤害，适配石破天等高内力弟子，血战江湖玩法中优先级最高。黯然销魂掌触发几率高、伤害稳定，适合赵敏、宋远桥等高内高攻或均衡型弟子，单体与小范围输出表现均衡。降龙十八掌是群体伤害天花板，虽触发几率偏低，但适配萧峰、郭靖等缘分弟子时伤害拉满，群雄破阵玩法中清场效果显著。独孤九剑适配性最广，高攻与均衡弟子均可佩戴，触发几率高，推图与竞技场景通用。乾坤大挪移威力强但触发低，适合紫衫龙王、任我行等缘分弟子，依赖缘分提升触发率。打狗棒法伤害次于降龙十八掌，适配周芷若等缘分弟子，特定阵容中可作为补充群攻。
内功以被动增益为主，甲级九阳神功侧重内力加成，适合高内力弟子提升技能上限，但实战适配场景较少。乙级内功性价比高，化功提升攻击，获取难度低，33级可掉落残章，适配各类输出弟子。金钟罩强化防御，适合前排肉盾弟子，提升生存能力。长生功增加内力上限，适配依赖内力触发技能的弟子，保障技能释放频率。武功搭配需遵循弟子定位，输出弟子配高伤外功与化功，肉盾配金钟罩与长生功，均衡弟子可组合黯然销魂掌与九阳神功。
武功养成与获取是核心玩法，每名弟子可装备1个天赋武功与3个后天武功，第四个武功槽需弟子闭关一重后开启，五重闭关可解锁武功满额效果。武功升级需通过参悟低级武功提升，残章是获取高级武功的关键，可通过抢夺残章、参拜无量洞、开启宝箱或击败精英敌人获取。抢夺残章时可挑战高等级玩家提升掉落率，换批对手可规避强敌，高效收集所需残章。实战中需结合玩法调整配置，血战江湖优先天山六阳掌与独孤九剑，竞技对决侧重黯然销魂掌与乾坤大挪移，群雄破阵以降龙十八掌为核心，灵活搭配才能发挥武功最大价值。