燕云十六声叛逃门派会清空当前门派全部声望、贡献与职位，触发对应的叛逃惩罚，同时解锁24小时门派切换冷却，部分门派还有专属的退派前置条件，已经学习的门派武学、兑换得到的门派外观可以正常保留使用。叛逃成功之后角色直接脱离原有门派，短时间内无法进入原门派驻地，门派周常任务、每周福利奖励、门派商店兑换权限会全部关闭，正在推进的门派专属剧情任务也会暂时卡住不能继续完成，如果后续打算重回原本门派，需要从零开始重新刷取门派声望，之前积攒的所有进度都不会继承返还。
除九流门以外，其余门派叛逃之后都会触发绝义试炼状态，状态持续七天，在此期间系统有可能在任意场景、任意玩法中途强制将角色拉入觉障林战场。进入觉障林之后角色身份为局外人，不需要主动进攻其他玩家，只要坚持对局结束或者被场内其他玩家击败，就能完成本次试炼，部分情况下七天状态结束，也没有被传送进入觉障林，绝义试炼标记同样可以自动消除，中途直接加入新门派也不会跳过绝义试炼的随机触发机制，需要继续等待试炼完成。九流门属于特例，选择叛逃不需要挑战觉障林，但是必须支付5万周元通宝的赎身费用，费用缴纳完毕才可以正式完成退派流程，没有凑齐货币的情况下无法提交叛逃申请。
叛逃之后的24小时冷却时间之内，不能申请加入任何门派，冷却结束之后既可以选择加入全新门派，也可以重新申请回归原先离开的门派，但是短时间之内反复叛逃会有额外的限制，从叛出某个门派开始的六天时间段里，就算成功重新加入，也不能够再次叛逃该门派，频繁跨门派跳槽会大幅拉长养成周期，需要反复重做声望任务解锁门派商店、驻地玩法以及各类门派奖励。叛派不会重置角色大世界探索进度、通用装备和江湖身份，大世界任务、支线奇遇大部分不受影响，只有绑定原门派的专属奇遇会暂时处于锁定状态。
玩家计划叛逃门派前，最好提前把手里剩余的门派币全部消耗完毕，领完本周已经刷新的门派奖励，用完门派商店的兑换额度，避免大量门派资源直接作废造成不必要的损失。如果本身还在推进重要门派剧情，建议优先做完主线门派任务再提交叛逃，防止剧情卡死无法继续推进，预算不足的玩家尽量不要轻易从九流门叛逃，高额的赎身费对于前期资源紧缺的角色负担很重。打算更换门派学习新武学的玩家也要提前规划，叛逃只能解除当前门派身份，没办法直接继承其他门派武学，加入新门派之后依旧需要一步步提升声望解锁招式。