鸣潮想要使用别的船只分为码头选型更换与野外临时征用两种方式，码头可永久切换解锁船型，野外能临时占用场景闲置船只完成短途航行与水域探索。
码头更换其他船只需要前往黎那汐塔与利乔群岛任意已解锁码头交互出航面板，面板船篷选型栏会罗列玩家通过渔业委托、商店兑换解锁的全部船只，选定目标船型后确认出航即可完成船只更换，不同船只自带专属被动加成，提速款船只适合大范围海域跑图，扩容船仓款式适配长线钓鱼搜集资源，切换船只不会清空已有船仓渔获，仅重置快速回港冷却，不少玩家会利用跨码头换船刷新回城机制，缩减反复返航的赶路耗时，解锁新船需要积攒水产代币在码头商铺兑换，每日渔业委托是稳定获取代币的核心途径，优先做完委托才能逐步解锁高阶船型。
野外征用野外闲置NPC船只无需解锁与消耗资源，黎那汐塔城内河道、沿海浅滩会随机刷新无人停靠的贡多拉，角色靠近船体后跳出落水再连续点击驾驶交互键，就能接管船只控制权，这类临时船只无法带回码头保存，离船传送后直接消失，适合顺路开启河道隐藏宝箱、抵达陆路无法通行的孤岛点位，部分隐蔽支线任务指定需要征用野外船只抵达任务区域，错过就近船只会大幅绕路，夜间海域刷新的幽灵船无法正常驾驶，靠近会触发小怪袭击，不要尝试登船操作浪费探索时间。
跨区域调船可借助地图传送联动换船，驾驶原有船只停靠任意码头后下船传送至其他水域码头，再次开启出航界面切换已解锁船只，新船会直接刷新在当前码头泊位，原有停靠在别处的船只自动收回船库，该操作能灵活搭配不同场景需求，前往深水远海选用高航速大船，城内狭窄河道切换小巧贡多拉，兼顾航行效率与地形适配，搭配角色同行乘船时更换船只，已邀约的随行角色会自动保留在新船上，反复更换不同船只搭载新角色，还能陆续解锁乘船成就与角色好感加成，是低成本提升角色好感的实用玩法。