口袋妖怪火红中，通关并获得全国图鉴后，三圣兽（雷公、炎帝、水君）会在关都地区草丛随机游走，捕捉核心是用“踩影/黑色目光”锁逃跑、黄金喷雾过滤杂鱼、刀背击打控血+催眠/麻痹控状态，再用高级球/时间球反复尝试即可稳定捕捉。
触发三圣兽刷新的前提是击败四大天王并从大木博士处拿到全国图鉴，之后三只50级圣兽会在关都除室内、水域外的所有草丛随机生成，且每次切换地图或进入建筑都会重置位置。初始伙伴决定可遇圣兽：选妙蛙种子遇炎帝、选杰尼龟遇雷公、选小火龙遇水君，无法同时遇到三只。高频刷新点集中在2号道路（常青森林附近）、7号道路（彩虹市左侧）、无人发电厂周边（雷公）、灯火山附近（炎帝）、水路沿岸草丛（水君），可反复进出建筑刷新位置提升偶遇率。
捕捉前需准备核心配置：首位放40-49级宝可梦+黄金喷雾，完全过滤低等级野生精灵，确保遇敌必是圣兽；队伍必备会“黑色目光”（耿鬼、大嘴蝠）或踩影特性（果然翁）的宝可梦，防止首回合逃跑；带会刀背击打（可留1点血）的宝可梦，以及催眠粉/催眠术、麻痹粉等控场技能；道具备30个以上高级球、10个时间球、少量大师球，搭配足量回血与解状态道具。遇圣兽前务必存档，避免误杀或球耗尽时可重读档挑战。
实战捕捉流程需精准操作：遇圣兽后立刻换锁逃跑宝可梦，首回合用黑色目光或踩影锁定；随后换刀背击打宝可梦，将血量精准压至1点，避免暴击击杀；接着用催眠或麻痹技能控场，睡眠状态可显著提升捕捉率，禁止用中毒、烧伤等持续掉血状态；之后循环扔高级球，30回合后改用时间球，效果更佳；若圣兽苏醒逃跑，立即读档重来，重复操作直至捕捉成功。
三圣兽属性各有优势，捕捉后可针对性培养：雷公电系，速度快荣耀足球（星耀），、特攻高，适合速攻阵容；炎帝火系，物攻与耐久均衡，可走输出或半肉路线；水君水系，耐久顶尖、辅助技能丰富，适合消耗与联防。捕捉后可搭配努力值刷取、性格匹配与技能搭配，最大化发挥其对战价值，成为队伍核心战力。